337 पेपर
प्राचीन डीएनए चयन संकेतों को आधुनिक जीनोमिक डेटा के साथ एकीकृत करते हुए, यह अध्ययन प्रकट करता है कि पिछले 10,000 वर्षों में प्राकृतिक चयन ने संक्रामक रोगों से बेहतर मुकाबला करने के लिए मानव प्रतिरक्षा प्रणाली को उन्नत किया है, जिसके परिणामस्वरूप संक्रमणों के विरुद्ध एक सुरक्षात्मक प्रभाव तो हुआ है लेकिन कुछ ऑटोइम्यून और सूजन संबंधी स्थितियों के लिए जोखिम भी बढ़ गया है।
यह अध्ययन यह प्रदर्शित करने के लिए एक नया प्रयोगात्मक ढांचा स्थापित करता है कि गुफाओं में रहने वाले *Astyanax mexicanus* विकसित माइक्रोग्लियल अंतर प्रदर्शित करते हैं, जिसमें कोशिकाओं की संख्या में वृद्धि, विशिष्ट सूजन संबंधी प्रतिक्रियाएं और उन्नत लाइसोसोमल गतिविधि शामिल है, जो संभवतः सतह की आबादी की तुलना में उनके अद्वितीय न्यूरोइम्यून अनुकूलन का आधार बनते हैं।
यह अध्ययन *Candidatus* Centrionella anaeramoebae का लक्षण वर्णन करता है, जो *Anaeramoeba pumila* का एक दुर्लभ अवायवीय (anaerobic) लेजियोनेलालेस (Legionellales) सहजीवी है, जिसने जीनोम न्यूनीकरण (genome reduction) किया है, क्षैतिज स्थानांतरण (horizontal transfer) के माध्यम से मेजबान-व्युत्पन्न GTPase जीन प्राप्त किए हैं, और सिम्बायोसोम (symbiosome) संरचना को खो दिया है, जिससे यह एरोबिक रोगजनकता (aerobic pathogenesis) से अवायवीय सहजीविता (anaerobic mutualism) की विकासवादी संक्रमण के लिए एक अद्वितीय मॉडल प्रस्तुत करता है।
यह अध्ययन फाइलोगैनेटिक तुलनात्मक इंटरेक्शन विधियों को पेश करता है ताकि यह प्रदर्शित किया जा सके कि डार्टर क्लाड्स (darter clades) के साथ प्रतिस्पर्धा ने संभवतः उत्तरी अमेरिकी अंधे गुफा मछलियों द्वारा गुफाओं के बार-बार उपनिवेशीकरण को प्रेरित किया, जो जीवित टैक्सों का उपयोग करके मैक्रोइवोल्यूशनरी पारिस्थितिक अंतःक्रियाओं का परीक्षण करने के लिए एक नया ढांचा प्रस्तुत करता है।
निकट-पूर्ण माइटोकॉन्ड्रियल जीनोम और परमाणु लोकी का विश्लेषण करके, यह अध्ययन चमगादड़-सीमित वंश *Nycteria* और *Polychromophilus* के पूर्व में विवादास्पद फाइलोगैनेटिक स्थान को एक दृढ़ता से समर्थित मोनोफाइलेटिक क्लेड के रूप में स्पष्ट करता है, जो यह प्रदर्शित करता है कि हेमोस्पोरिडा (Haemosporida) के विकासवादी इतिहास के सटीक पुनर्निर्माण के लिए विस्तारित जीनोमिक डेटा आवश्यक है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि मीठे पानी के स्पंजों ने पार्श्व जीन स्थानांतरण (lateral gene transfer) के माध्यम से सूक्ष्मजीव संबंधी रोडोक्विनोन जैव-संश्लेषण जीन *rquA* प्राप्त किया है, जिससे वे रोडोक्विनोन का संश्लेषण करने में सक्षम हुए हैं और संभावित रूप से कम ऑक्सीजन वाले वातावरण के प्रति उनकी सहनशीलता बढ़ी है।
यह अध्ययन ठोस प्रयोगात्मक प्रमाण प्रदान करता है कि यादृच्छिक अनुक्रम क्लोन (random sequence clones) का एक उपसमुच्चय विशिष्ट विकास स्थितियों के तहत *E. coli* को वास्तविक रूप से फिटनेस लाभ प्रदान करता है, जिससे गैर-कोडिंग अनुक्रमों की अनुकूलन कार्यों को उत्पन्न करने की क्षमता प्रमाणित होती है और *de novo* जीन विकास की प्रक्रिया को समर्थन मिलता है।
यह शोध पत्र एक एकल महामारी विज्ञान मॉडल प्रस्तावित करता है जो यह स्पष्ट करता है कि कैसे रोगजनक वातावरण की संरचना यूसोशल (eusocial) प्रजातियों में विचलित जीवनकाल रणनीतियों के विकास को संचालित करती है, जहाँ दीर्घकालिक परजीवी जाति-विशिष्ट बुढ़ापे और परोपकारी श्रमिक मृत्यु को बढ़ावा देते हैं, जबकि सौम्य रोगजनक सभी जातियों में नगण्य वृद्धावस्था की ओर ले जाते हैं।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि फंगस ग्नेट *Bradysia coprophila* में, एक मातृ आनुवंशिक लिंग-निर्धारण क्षेत्र मादा प्रजनन रूपाकारों (morphs) को विशिष्ट जीवन इतिहास और जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइल में अनुकूलनशील विचलन की ओर प्रेरित करता है, जिससे लैंगिक द्विरूपता और लिंग गुणसूत्र विकास के मूल सिद्धांतों का विस्तार मातृ लिंग-निर्धारण प्रणालियों तक होता है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि बड़े फाइलोगेनी (phylogenies) में अभिसारी विकास (convergent evolution) का विश्लेषण, विशिष्ट रिसेप्टर-बाइंडिंग साइट प्रतिस्थापन (receptor-binding site substitutions) की पहचान करके, जो प्रमुखता से प्रभावी होने से पहले ही सकारात्मक चयन (positive selection) के अधीन होते हैं, एक वर्ष पहले ही H3N2 इन्फ्लुएंजा वायरस में प्रमुख एंटीजेनिक बदलावों (antigenic shifts) की भविष्यवाणी कर सकता है।